清洗剂种类目前食品行业应用的清洗剂种类很多，主要有酸碱类等，其中氢氧化钠和硝酸应用最为广泛。碱类洗涤剂对含蛋白质较高的污物有很好的去除作用，但对食品橡胶垫圈等有一定腐蚀作用。酸类洗涤剂对碱性清洗剂不能去除的顽垢有较好效果，但对金属有一定的腐蚀性，应添加一些抗腐蚀剂或用清水冲洗干净。清洗剂还有表面活性剂、螯合剂等，但只在特殊需要时才使用，如清洗用水硬度较高时可使用螯合剂去除金属离子。
清洗剂浓度提高清洗剂浓度时，可适当缩短CIP清洗系统的时间或弥补清洗温度的不足。清洗剂浓度增高会造成清洗费用的增加，而且浓度的增高并不一定能有效地提高清洗效果，因此厂家有必要根据实际情况确定合适的浓度。
CIP清洗洗液温度通常而言，温度每升高10℃，化学反应速度会提高1．5—2．0倍，清洗速度也相应提高，清洗效果较好。清洗温度一般不低于60℃。
清洗时间清洗时间受许多因素的影响，如清洗剂种类、浓度、清洗温度、产品特性、生产管线布置以及设备设计等。清洗时间必须合适，太短不能对污物进行有效去除，太长则浪费资源。
以饮料行业为例，其CIP原位清洗系统程序如下：
1．洗涤3—5分钟，常温或60℃以上的热水；碱洗10—20分钟，1％—2％溶液，60℃—80℃；中间洗涤5—10分钟，60℃以下的清水；最后洗涤3—5分钟，清水。
2．洗涤3—5分钟，常温或60℃以上的热水；碱洗5—10分钟，1％—2％溶液，60℃—80℃，中间洗涤5—10分钟，60℃以下的清水，杀菌10—20分钟，90℃以上的热水。
CIP清洗系统的流量保证流量实际上是为了保证清洗时的清洗液流速，从而产生一定的机械作用，即通过提高流体的湍动性来提高冲击力，取得一定的清洗效果。
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